环境科技创新人才培养基地是教育部“面向二十一世纪教育振兴行动计划”子项目。创新基地以大学生“创新精神和实践能力”的培养为目标，运用学生与教师合作的“双主”方式，实现了环境学科研究优势和科研条件在创新人才培养上发挥重要作用。学院设立《 环境学院大学生科技创新基金》 ，每年资助约20 个创新基地大学生科技创新研究团队，使学生在充满学术气氛的环境中得到实践锻炼和创新能力的提高。2005年，环境科技创新人才培养基地获得上海市教育成果二等奖。2006年，喜获同济大学2006年度校长奖。
3年来，环境学院科技创新人才培养基地已培养科技创新人才共六批400余名，涌现了一批优秀优秀科技创新人才和学生科技创新报告。《合流雨水泵站直排河道的消毒技术研究》、《城市污水紫外消毒技术研究》等23个项目获得同济大学大学生课外科技基金支持。陆正华、许健等同学的项目“工业废水再生与回用的反渗透处理工艺”获得第四届陈嘉庚青少年发明奖（上海）三等奖，成果喜人。 v
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